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O-Pair Search方法可对O-糖肽进行表征—小柯机器人—科学网
发布日期:2020-10-28 12:50   来源:未知   阅读:

  美国威斯康辛大学Lloyd M. Smith研究团队开发的O-Pair Search方法可实现对O-糖肽进行表征。这一研究成果于2020年10月26日发表在国际学术期刊《自然-方法学》上。

  研究人员研发了O-Pair Search,这是一种鉴别O-糖肽和O-糖苷位置的方法。使用成对电子碰撞和基于电子的解离光谱,O-Pair Search通过离子索引开放修饰来识别O-糖肽,并使用图论和基于概率定位的方法对O-糖苷进行定位。与当前已有的O-糖肽处理软件相比,O-Pair Search所需的搜索时间减少了2000倍以上,同时增加了O-糖苷定位的置信度并鉴定了更多的O-糖肽。

  除了已讨论的粘蛋白O-糖肽外,O-Pair Search还可用于用户定义的聚糖数据库,从而使其与许多类型的O-糖基化兼容。O-Pair Search可在开源MetaMorpheus平台上免费获得,网址为。